Supp AI使用机器学习来识别补充交互
2019年09月20日 由 TGS 发表
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2015年,艾伦人工智能研究所(Allen institute for Artificial intelligence)发布了语义学者(Semantic Scholar),这是一个公共人工智能搜索引擎,能够从超过1.73亿份计算机科学和生物医学期刊论文中提取数据。虽然一时间受到了热烈的欢迎,但该研究所的研究人员却并不满足,他们想要尝试,把Semantic Scholar基本算法用于解决医学研究领域的其他问题上面。
为此,艾伦研究所本周推出了门户网站Supp AI,帮助使用维生素、矿物质、酶和激素等补充剂的消费者,识别出可能会与之产生不利影响的产品或药物。——通过一个简单的搜索栏,输入常用药物(如百忧解和沙拉非姆)的商品名和有效药物成分(氟西汀)的名称,从支持相互作用的研究论文中弹出句子,同时链接到每个来源。
例如,对银杏补充剂的研究发现,它与华法林和一氧化氮等物质可能存在140种相互作用。
Supp AI不仅可以显示所有可能与查询补充物交互的化学物质或药物,还可以根据相关元数据对证据句进行排序,并对源文件进行优先级排序。——影响最终排序的因素包括(但不限于)非撤销研究、临床试验、人体研究和近因。
在Supp AI部署之前,2950万条自动标注的句子被输入到BERT-DDI模型中(一种补充药物相互作用证据提取器),促使补充品和药物CUIs的策展列表被用来删除不相关的句子,并将相关的证据分组在一起,每个句子都用原始论文的元数据(如标题、作者、发表地点、撤回状态和发表年份)进行注释。
为了评估提取句子的质量,研究小组的实验人员抽取了200个样本,并手工标记了这些句子中提到的补充语的相互作用。最终结果不负众望,BERT-DDI模型的准确率为87%,精确度为77%(正确预测的阳性观测值与总预测阳性观测值的比值),召回率为96%(分类器找到所有阳性样本的能力)。
研究人员表示,近期的目标是定期更新Supp AI,将新论文中提取的最新信息纳入语义学者资料库。未来发布的版本可能会显示相互作用的严重程度,或者可能会建议使用补充剂来增强其他补充剂或药物的效果,并列出这些补充剂或药物已被证明有效的场景或情况。
Supp AI网址:
https://supp.ai