Enformer

Enformer模型。它在Avsec等人的论文中首次提出，并于 this repository 年首次发布。

此存储库包含由Deepmind官方发布的权重，已转换为Pytorch。

模型描述

Enformer是一种基于Transformer的神经网络架构，可大大提高从DNA序列预测基因表达的准确性。

有关详细信息，请参阅发表在Nature上的 paper 。

如何使用

有关使用方法，请参阅 enformer-pytorch 的README。

引用信息

Avsec, Ž., Agarwal, V., Visentin, D. et al. Effective gene expression prediction from sequence by integrating long-range interactions. Nat Methods 18, 1196–1203 (2021). https://doi.org/10.1038/s41592-021-01252-x